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男性生殖器官分为内外两部分。外生殖器包括阴茎、阴囊和尿道。其中阴茎是进行性交的器官，它的结构比较特殊，是由几对含有极丰富血管的海绵体所组成。当有性冲动的感觉时，海绵体内的血管会充血鼓胀，使阴茎变粗，质地变硬，这就是阴茎的勃起。正是由于阴茎的勃起，才使男女两性间的性行为能顺利进行。阴茎的前端是龟头，由于分布着很密的神经纤维，感觉特别敏锐。但在青春期以前，龟头往往被其周围一层皱折的皮肤所包裹，这就是包皮。当性器官开始发育后，包皮渐渐退缩使龟头暴露出来，也有个别的男孩，由于包皮过长，即使在青春期发育后，龟头仍不能外露，平时又不太注意外阴部的清洁，分泌物在此积聚而形成包皮垢，若长期刺激龟头表面粘膜，可能造成癌变。包皮垢也可能引起局部发炎，使过长的包皮与龟头粘连在一起，称为包茎。不论是包皮长或包茎，一旦发现后应进行手术切除（手术较简单），以免后患。
阴囊在阴茎的末端，是由皱折的皮肤所构成的“小口袋”。分左右两半，内各有一个睾丸及附睾。睾丸对温度的要求比较严格，有特殊构造的阴囊皮肤就起到了调节温度的作用。当天气炎热或人因生病而发热时，阴囊的皮肤立即松驰，使温度下降。而当气温降低时阴囊又皱缩，紧紧地包着睾丸，并尽量向身体靠近，以增加温度。阴囊的这种调节功能是睾丸能产生正常精子的重要保证。
尿道是一条细长的管子，一端连结着腹腔内的膀胱，另一端开口在阴茎龟头的顶端。尿道，是人体排出尿液的通道，属于排泄系统的器官。但由于男性的精液也是由尿道排出体外的，所以也被列为生殖器官的一个组成部分。
男性的内生殖器中，睾丸是主性器官，它的主要功能与女性的卵巢相类似，产生生殖细胞——精子及分泌雄激素——睾酮，因此睾丸的结构与功能的正常是保证男性生殖器发育、第二性征出现的重要因素。如果在幼年时切除了睾丸（像古代皇宫中的太监），到了青春期发育时，男性的第二性征就不出现，更无生殖能力。也有些男性虽有睾丸，但在胎儿或婴儿期没有从腹腔下降至阴囊里，这种叫做“隐睾症”。如果不及时发现及治疗，也会影响性发育及性功能。根据近年来的体格检查发现，患隐睾症的儿童的人数不少，应加以注意。
除睾丸以外，内生殖器还有附睾、输精管、精囊、射精管、前列腺等。
男孩到15岁左右时，由于生殖器官发育及功能的逐步成熟，睾丸不断生成的精子与精囊、前列腺液混合，积聚到一定的量，这时虽然并未发生性活动，但也会从尿道射出精液，这种现象称为遗精。有些人会在睡梦中发生遗精，如果每隔十天半月发生一次，是属于正常的生理现象，不用担心，以免增加思想负担。
女性的生殖系统，按其解剖位置的不同，也可分为内外两部分。内生殖器官主要由卵巢、输卵管、子宫及阴道组成；外生殖系统包括大小阴唇、阴阜、阴蒂、处女膜等。
内生殖器中卵巢是主性器官，位于盆腔的两侧，左右各有一个。有的女性在生育前得了卵巢肿瘤疾病，把一侧的卵巢切除了，只要另一侧的功能健全，照样能怀孕，并能生出健康活泼的小宝宝。卵巢的功能主要有两个：一是产生生殖细胞——卵子，二是分泌性激素，包括雌激素、孕激素以及少量的雄激素。雌激素能促进女性内外生殖器及第二性征的发育。孕激素，顾名思义一定是与女性的怀孕过程有关，它的主要作用是使受精卵在子宫内安安稳稳地“定居”，并维持妊娠的全过程。此外，还与雌激素一起，通过分泌量的周期性变化，使子宫内膜不断脱落、新生，而产生月经周期。
阴道，是内外生殖器的连接部分。主要由肌肉组成。它既是性交的主要器官，又是月经排出及胎儿娩出时的必经之路。阴道口有一层薄膜覆盖，叫做“处女膜”，膜中央有一个小孔，以便于月经能顺利地排出。由于每个女性处女膜的厚度及坚韧度不一样，特别薄的人在从事剧烈的运动或不小心碰撞了会阴部附近的组织时，处女膜就会破裂。当然，大多数女性是在初次性交时才破裂，并伴有少量的出血。所以，我们不能绝对地以初次性交时的出血与否，作为判断女性是否为处女的唯一依据。
女性的外生殖器因含丰富的脂肪组织，因而质地柔软。外生殖器的主要功能是进行性交及分娩时便于胎儿的娩出。因此，其结构也与功能有密切的关系，有的是性感的敏锐区，有些能分泌一定的液体以润滑阴道口，使性交过程能顺利进行。丰富的脂肪组织则更起到了缓冲与保护作用。为此，在日常的生活中，尤其是在参加重体力劳动或剧烈体育运动时，要注意保护，避免损伤。
