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1．FAT12:一种非常“古老”的磁盘分区方式（与DOS同时问世），它采用12位的文件分区表，能够管理的磁盘容量极为有限，目前除了软盘驱动器还在采用FAT12之外，它基本上已经没有什么用武之地了。
2．FAT16:MS－DOS及老版本的Windows95大多是FAT16格式，它采用16位的磁盘分区表，所能管理的磁盘容量较FAT12有了较大提高，最大能支持2GB的磁盘分区，磁盘的读取速度也较快，是目前应用非常广泛的一种分区形式。FAT16有一个非常独特的优点，那就是它的兼容性非常好，几乎所有的操作系统（如DOS、Windows95、Windows98、WindowsNT、Linux等）都支持该分区模式，不少同时使用多种操作系统的用户都是利用它来在不同操作系统中进行数据交流和交换的。
FAT16的缺点也非常明显，那就是磁盘利用效率较低——在DOS及Windows系统中，磁盘文件的分配是以簇为单位的，一个簇只能分配给一个文件使用（即使该簇的容量有32KB，而某个文件仅仅占用了其中的一个字节也不例外），这就不可避免的导致磁盘空间的浪费（该簇中没有被使用的容量就被浪费了）。而从理论上来说，平均每个文件所浪费的磁盘空间为簇容量的一半，即一个簇的容量若为4KB，那么每个文件所浪费的空间就是2KB，若一个簇得容量为32KB，那么每个文件所浪费的空间就是16KB。由于分区表容量的限制，FAT16的分区容量越大，则磁盘上每个簇的容量就越大，浪费的磁盘空间也就跟着呈几何级的增长。如在一个容量为2GB的磁盘分区采用FAT16格式，那么它的一个簇是32KB，每个文件就要浪费16KB，若该磁盘分区上有20480个文件，则浪费的空间为20480＊16/1024=320MB，简直令人难以想象！
3．FAT32:正是为了解决前述问题，微软公司从Windows95OSR2（Windows97）起推出了一种新的文件分区模式FAT32。FAT32采用了32位的文件分配表，管理硬盘的能力得以极大的提高，轻易地突破了FAT16对磁盘分区容量的限制，达到了创纪录的2000GB，从而使得我们无论使用多大的硬盘都可以将它们定义为一个分区，极大地方便了广大用户对磁盘的综合管理。更重要的是，在一个分区不超过8GB的前提下FAT32分区每个簇的容量都固定为4KB，这就比FAT16要小了许多，从而使得磁盘的利用率得以极大的提高。如同样是前面那个2G的磁盘分区，采用FAT32之后，其每个簇的大小变为了4K，这就使得每个文件平均所浪费的磁盘空间降为2K，假设硬盘上保存着20480个文件，则浪费的磁盘空间为20480＊2/1024=40M。一个要浪费320M，另外一个仅浪费40M，FAT32的效率之高由此可见一斑。
当然，FAT32也决非十全十美，它也有一些固有的缺点:首先，FAT32的兼容性不太好，目前只有Windows97、98以及Windows2000支持FAT32，其他操作系统（如DOS、Linux等）都不支持FAT32，这就影响了用户数据的交流;其次，由于文件分配表的扩大，使得FAT32的磁盘运行速度相对来说较FAT16要慢一些（在Windows图形界面下反映得并不明显，但在安全模式及MS－DOS状态下将会显出较大的差距）;第三:FAT32在某些磁盘操作方式上对系统进行了修改，从而使得我们的某些常规磁盘操作不能继续进行（如FAT32不支持磁盘压缩技术，我们不能对采用FAT32的分区进行压缩、不能在FAT32中使用那些老式的磁盘处理程序等）。有特殊要求的用户（如在使用Windows98的同时还需要使用DOS的用户）绝对不能轻易地将所有的磁盘分区全部转换为FAT32格式。
4．NTFS:WindowsNT所采用的一种磁盘分区方式，它虽然也存在着兼容性不好的问题（目前仅有WindowsNT和即将问世的Windows2000才支持NTFS，其他操作系统都不支持），但它的安全性及稳定性却独树一帜——NTFS分区对用户权限作出了非常严格的限制，每个用户都只能按照系统赋予的权限进行操作，任何试图超越权限的操作都将被系统禁止，同时它还提供了容错结构日志，可以将用户的操作全部记录下来，从而保护了系统的安全。另外，NTFS还具有文件级修复及热修复功能、分区格式稳定、不易产生文件碎片等优点，这些都是其他分区格式所不能企及的。这些优点进一步增强了系统的安全性。
5．HPFS:一个已经“没落”的操作系统——IBM的OS/2所使用的磁盘分区格式，它在很多方面都与WindowsNT所使用的NTFS格式非常相似，鉴于目前国内很少有人使用OS/2，这里就不作详细介绍了。
6．Linux:目前非常时髦的免费操作系统Linux所使用的分区格式，它可细分为Linuxnative主分区和Linuxswap交换文件分区等两种。与NTFS一样，Linux分区的安全性及稳定性都比较好（可惜它们之间并不兼容），准备安装Linux的用户最好采用Linux格式。
二、不同操作系统对分区格式的支持情况
前面我们已经谈到，不同操作系统对分区格式的支持情况是不同的，有些操作系统只支持某种特定的分区格式，而有些操作系统则同时支持多种不同的分区格式。为方便用户的使用，现将常见操作系统对分区格式的支持情况简要介绍如下（多数操作系统在处理软盘时都采用的是FAT12格式，且该格式与FAT16基本类似，下面就不单独提及FAT12了）:
DOS和Windows95:这两种操作系统只支持FAT16，因此FAT16是这类用户的唯一选择。
Windows95OSR2(即所谓的Windows97):从Windows97开始，系统增加了对FAT32的支持，从而使得广大用户可同时使用FAT16和FAT32。
Windows98:Windows98在分区格式方面与Windows97完全相同，我们可同时使用FAT16和FAT32这两种分区格式。不过在Windows95OSR2中，我们只能通过FDISK来建立新的FAT32分区，而在Windows98中，我们则可通过驱动器转换器程序（CVT1.EXE）将FAT16直接转换为FAT32（可惜不能逆转换），这就方便了用户对FAT32的使用。另外，在某些补丁程序的帮助下，我们还可以让Windows98采用只读方式读取NTFS分区中的文件，但不能对其进行删除、改写等操作。
WindowsNT:NTFS就是专门为WindowsNT量身定制的，在WindowsNT中使用NTFS分区当然也就不存在任何疑问。WindowsNT同时也支持FAT16，广大用户若不太关心系统的安全性，也可直接采用FAT16分区。另外，与在Windows98中使用NTFS一样，在某些补丁程序的帮助下，我们也可以让WindowsNT采用只读方式读取FAT32中的文件。
Windows2000:作为Windows98和WindowsNT共同的“升级版”，Windows2000同时支持FAT16、FAT32、NTFS等分区格式，广大用户可根据需要加以选择。
OS/2:OS/2用户既可使用OS/2独特的HPFS分区格式，也可使用传统的FAT16。
Linux:Linux用户一般都使用其专用的Linux格式。
